Biology:Spirochaeta
Spirochaeta | |
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A microscopic photograph of fluorescent-stained Spirochaeta americana | |
Scientific classification | |
Domain: | Bacteria |
Phylum: | Spirochaetota |
Class: | Spirochaetia |
Order: | Spirochaetales |
Family: | Spirochaetaceae |
Genus: | Spirochaeta Ehrenberg 1835 non Turczaninow 1851 |
Type species | |
Spirochaeta plicatilis Ehrenberg 1835
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Species | |
See text | |
Synonyms | |
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Spirochaeta is a genus of bacteria classified within the phylum Spirochaetota.[1][2]
Phylogeny
The currently accepted taxonomy is based on the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) [1] and National Center for Biotechnology Information (NCBI).[2]
16S rRNA based LTP_08_2023[3][4][5] | 120 single copy marker proteins based GTDB 08-RS214[6][7][8] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Species incertae sedis:
- Spirochaeta plicatilis Ehrenberg 1835 (type sp.)
- "Spirochaeta taiwanensis" Chi-Yu & Cai-Ji 2004
- Spirochaeta xylanolyticus Yeh & Huang 2004
See also
References
- ↑ 1.0 1.1 J.P. Euzéby. "Spirochaeta". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). https://lpsn.dsmz.de/genus/spirochaeta.
- ↑ 2.0 2.1 Sayers. "Spirochaeta". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=146&lvl=6&lin=f&keep=1&srchmode=1&unlock.
- ↑ "The LTP". https://imedea.uib-csic.es/mmg/ltp/#LTP.
- ↑ "LTP_all tree in newick format". https://imedea.uib-csic.es/mmg/ltp/wp-content/uploads/ltp/LTP_all_08_2023.ntree.
- ↑ "LTP_08_2023 Release Notes". https://imedea.uib-csic.es/mmg/ltp/wp-content/uploads/ltp/LTP_08_2023_release_notes.pdf.
- ↑ "GTDB release 08-RS214". https://gtdb.ecogenomic.org/about#4%7C.
- ↑ "bac120_r214.sp_label". https://data.gtdb.ecogenomic.org/releases/release214/214.0/auxillary_files/bac120_r214.sp_labels.tree.
- ↑ "Taxon History". https://gtdb.ecogenomic.org/taxon_history/.
Wikidata ☰ Q7578174 entry
Original source: https://en.wikipedia.org/wiki/Spirochaeta.
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