Biology:Edaphobacter
Edaphobacter is a genus of Gram-negative, rod shaped bacteria.[1] It contains seven species:[2]
Phylogeny
The currently accepted taxonomy is based on the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[2] and National Center for Biotechnology Information (NCBI).[3]
| 16S rRNA based LTP_10_2024[4][5][6] | 120 marker proteins based GTDB 10-RS226[7][8][9] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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See also
References
- ↑ Koch, I. H.; Gich, F.; Dunfield, P. F.; Overmann, J. (1 May 2008). "Edaphobacter modestus gen. nov., sp. nov., and Edaphobacter aggregans sp. nov., acidobacteria isolated from alpine and forest soils". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 58 (5): 1114–1122. doi:10.1099/ijs.0.65303-0. PMID 18450699.
- ↑ 2.0 2.1 Edaphobacter in LPSN; Freese, H. M.; Meier-Kolthoff, J. P.; Sardà Carbasse, J.; Afolayan, A. O.; Göker, M. (29 October 2025). "TYGS and LPSN in 2025: a Global Core Biodata Resource for genome-based classification and nomenclature of prokaryotes within DSMZ Digital Diversity". Nucleic Acids Research 53: D1–D12. doi:10.1093/nar/gkaf1110.
- ↑ Schoch CL. "Edaphobacter". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?command=show&mode=tree&id=388463&lvl=3. Retrieved 2025-06-05.
- ↑ "The LTP". https://imedea.uib-csic.es/mmg/ltp/#LTP.
- ↑ "LTP_all tree in newick format". https://imedea.uib-csic.es/mmg/ltp/wp-content/uploads/ltp/LTP_all_10_2024.ntree.
- ↑ "LTP_10_2024 Release Notes". https://imedea.uib-csic.es/mmg/ltp/wp-content/uploads/ltp/LTP_10_2024_release_notes.pdf.
- ↑ "GTDB release 10-RS226". https://gtdb.ecogenomic.org/about#4%7C.
- ↑ "bac120_r226.sp_label". https://data.gtdb.ecogenomic.org/releases/release226/226.0/auxillary_files/bac120_r226.sp_labels.tree.
- ↑ "Taxon History". https://gtdb.ecogenomic.org/taxon_history/.
Wikidata ☰ Q21078645 entry
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